浸润肿瘤的免疫细胞可以通过发挥促肿瘤作用和抗肿瘤作用，从而影响肿瘤的进展以及抗癌治疗的成功。肿瘤浸润免疫细胞的量化有助于揭示免疫系统在人类癌症中的多方面作用，并参与肿瘤逃逸机制和对治疗的反应。借助CIBERSORT软件，我们可以从肿瘤RNA测序数据中量化肿瘤浸润的免疫细胞。
一、CIBERSORT软件介绍
CIBERSORT软件发表于年的NatureMethods。CIBERSORT是基于线性支持向量回归（linearsupportvectorregression）原理对人类免疫细胞亚型的表达矩阵进行去卷积的工具。用于芯片表达矩阵和测序表达矩阵，对未知混合物和含有相近的细胞类型的表达矩阵的去卷积分析优于其他方法(LLSR,LLSR,PERT,RLR,MMAD,DSA)。该方法基于已知参考数据集，默认提供22种免疫细胞亚型的基因表达特征集：LM22。
二、分析方法
CIBERSORT支持网页版和本地两种方法。CIBERSORT网页版链接为