包括下面几个软件的用法，是我刚入门写的了，感兴趣的去我博客搜索看看，意义不大，我就复制粘贴那些内容了，我讲一点别的：
solxaQA对测序数据进行简单过滤
RSQC对RNA-sq数据质控
NGSQCToolkit对测序rads进行简单过滤
fastqc对原始测序rads质控
但是QC的重要性！！！
如果没有充分理解你需要分析的数据，就贸然跑一大堆的软件，选择各种参数，这样意义不大！测序仪综述,了解测序原理。我会在我的博客里面持续更贴把QC给整理清楚：用sickl软件来对双端测序数据过滤低质量rads用cutadapt软件来对双端测序数据去除接头fastq定义;要了解fastq格式：